ในการทำต้นแบบเนกกาทีฟที่เป็น PCB ที่ใช้โปรแกรมออกแบบลายวงจรพิมพ์ก็สามารถทำได้เช่นกัน ในที่นี้ของแนะนำการทำต้นแบบเนกกาทีฟด้วยโปรแกรม Protel99SE มีขั้นตอนดังนี้
1.ออกแบบลายวงจรให้เสร็จตามต้อง
2.สร้างฉากหลังโดยเลือกใช้เลเยอร์ที่ไม่ได้ใช้งาน ในที่นี้เลือกใช้ KeepOutLayer แล้วสร้างฉากหลังโดยการกด P เลือก Fill ดังรูป
3. ลากครอบบริเวณลายวงจร
4. กดปุ่มเครื่องพิมพ์จะได้ดังรูป
5. คลิกขวาที่ Multilayer เลือก Properties ดังรูป